| 1 | FK Panevezys | 100,0% (1) | 1 | 12,0 |
| 2 | Ekranas | 87,5% (7) 12,5% (1) | 8 | 20,4 |
| 3 | D. Zagreb | 52,3% (23) 40,9% (18) 6,8% (3) | 44 | 22,2 |
| 4 | N. Baku | 50,0% (4) 50,0% (4) | 8 | 22,2 |
| 5 | Gr. Zürich | 35,0% (7) 60,0% (12) 5,0% (1) | 20 | 22,4 |
| 6 | Z. Sarajevo | 41,2% (7) 58,8% (10) | 17 | 22,5 |
| 7 | Waregem | 47,6% (10) 47,6% (10) 4,8% (1) | 21 | 22,5 |
| 8 | Nordsjælland | 51,6% (16) 32,3% (10) 16,1% (5) | 31 | 22,6 |
| 9 | Eindhoven | 43,2% (16) 45,9% (17) 10,8% (4) | 37 | 22,6 |
| 10 | C. Glasgow | 44,2% (19) 46,5% (20) 9,3% (4) | 43 | 22,8 |
| 11 | Sutjeska | 44,4% (4) 55,6% (5) | 9 | 22,9 |
| 12 | Schalke | 38,7% (12) 54,8% (17) 6,5% (2) | 31 | 23,1 |
| 13 | S. Tiraspol | 36,4% (8) 54,5% (12) 9,1% (2) | 22 | 23,2 |
| 14 | Arsenal | 40,5% (17) 45,2% (19) 14,3% (6) | 42 | 23,4 |
| 15 | P. Belgrad | 31,2% (10) 59,4% (19) 6,2% (2) 3,1% (1) | 32 | 23,4 |
| 16 | D. Tiflis | 43,8% (7) 43,8% (7) 12,5% (2) | 16 | 23,4 |
| 17 | Kalju | 50,0% (8) 18,8% (3) 31,2% (5) | 16 | 23,4 |
| 18 | L. Warschau | 42,4% (14) 39,4% (13) 15,2% (5) 3,0% (1) | 33 | 23,5 |
| 19 | Lyon | 32,5% (13) 50,0% (20) 10,0% (4) 5,0% (2) | 40 | 23,5 |
| 20 | Molde | 42,9% (12) 42,9% (12) 7,1% (2) 7,1% (2) | 28 | 23,5 |
| 21 | Fola Esch | 23,1% (3) 76,9% (10) | 13 | 23,6 |
| 22 | Salzburg | 33,3% (8) 54,2% (13) 8,3% (2) 4,2% (1) | 24 | 23,7 |
| 23 | SK SLovan | 35,0% (7) 45,0% (9) 20,0% (4) | 20 | 23,8 |
| 24 | FC Basel | 39,4% (13) 36,4% (12) 24,2% (8) | 33 | 23,9 |
| 25 | HJK Helsinki | 34,6% (9) 42,3% (11) 15,4% (4) 7,7% (2) | 26 | 24,1 |
| 26 | PAOK Saloniki | 36,1% (13) 41,7% (15) 16,7% (6) 5,6% (2) | 36 | 24,2 |
| 27 | Cliftonville | 33,3% (3) 55,6% (5) 11,1% (1) | 9 | 24,2 |
| 28 | Real Sociedad | 17,9% (7) 66,7% (26) 12,8% (5) | 39 | 24,3 |
| 29 | Ludogorets | 27,6% (8) 55,2% (16) 17,2% (5) | 29 | 24,3 |
| 30 | Birkirkara | 29,4% (5) 47,1% (8) 23,5% (4) | 17 | 24,4 |
| 31 | St. Petersburg | 38,1% (16) 38,1% (16) 14,3% (6) 7,1% (3) | 42 | 24,5 |
| 32 | V. Skopje | 33,3% (2) 33,3% (2) 33,3% (2) | 6 | 24,5 |
| 33 | Maribor | 29,6% (8) 51,9% (14) 14,8% (4) 3,7% (1) | 27 | 24,7 |
| 34 | AC Mailand | 37,2% (16) 34,9% (15) 23,3% (10) 4,7% (2) | 43 | 24,7 |
| 35 | Ferreira | 22,7% (5) 59,1% (13) 18,2% (4) | 22 | 24,9 |
| 36 | KF Skënderbe | 100,0% (3) | 3 | 25,0 |
| 37 | Elfsborg | 33,3% (8) 33,3% (8) 20,8% (5) 12,5% (3) | 24 | 25,0 |
| 38 | Hafnarfjördur | 44,4% (4) 22,2% (2) 22,2% (2) 11,1% (1) | 9 | 25,1 |
| 39 | Metalist | 20,8% (5) 58,3% (14) 16,7% (4) 4,2% (1) | 24 | 25,3 |
| 40 | Pilsen | 30,8% (12) 35,9% (14) 23,1% (9) 10,3% (4) | 39 | 25,4 |
| 41 | M. Tel Aviv | 20,0% (7) 28,6% (10) 17,1% (6) 5,7% (2) | 35 | 25,5 |
| 42 | Llansantffraid | 25,0% (5) 50,0% (10) 15,0% (3) 10,0% (2) | 20 | 25,5 |
| 43 | EB/Streymur | 15,4% (2) 61,5% (8) 15,4% (2) 7,7% (1) | 13 | 25,5 |
| 44 | Austria Wien | 38,2% (13) 44,1% (15) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 25,6 |
| 45 | BATE | 8,7% (2) 73,9% (17) 13,0% (3) 4,3% (1) | 23 | 25,7 |
| 46 | Daugavpils | 100,0% (4) | 4 | 25,8 |
| 47 | Sligo | 8,3% (1) 58,3% (7) 33,3% (4) | 12 | 25,9 |
| 48 | Gjumri | 28,6% (2) 42,9% (3) 28,6% (2) | 7 | 26,4 |
| 49 | Fenerbahce | 19,4% (6) 38,7% (12) 41,9% (13) | 31 | 26,5 |
| 50 | Qaraghandy | 21,1% (4) 42,1% (8) 36,8% (7) | 19 | 26,8 |
| 51 | Györ | 7,7% (1) 69,2% (9) 23,1% (3) | 13 | 26,8 |
| 52 | Tre Penne | 14,3% (1) 42,9% (3) 42,9% (3) | 7 | 27,1 |
| 53 | Korça | 18,2% (2) 45,5% (5) 9,1% (1) 27,3% (3) | 11 | 27,5 |
| 54 | Steaua | 13,5% (7) 50,0% (26) 19,2% (10) 5,8% (3) | 52 | 28,0 |
| 55 | Apoel FC | 13,3% (4) 23,3% (7) 20,0% (6) 16,7% (5) | 30 | 30,0 |
| 56 | Lusitanos | 40,0% (2) 20,0% (1) 40,0% (2) | 5 | 32,2 |
Champions League-Qualifikation
