| 1 | NK Celje | 40,0% (6) 46,7% (7) 6,7% (1) | 15 | 22,4 |
| 2 | Alkmaar | 40,6% (13) 50,0% (16) 9,4% (3) | 32 | 23,0 |
| 3 | Rapid Wien | 45,2% (14) 41,9% (13) 9,7% (3) | 31 | 23,3 |
| 4 | L. Zagreb | 42,1% (24) 42,1% (24) 12,3% (7) 3,5% (2) | 57 | 23,4 |
| 5 | Salzburg | 48,4% (15) 38,7% (12) 3,2% (1) 9,7% (3) | 31 | 23,5 |
| 6 | C. Glasgow | 31,7% (13) 58,5% (24) 9,8% (4) | 41 | 23,5 |
| 7 | Dynamo Kiev | 37,5% (21) 48,2% (27) 12,5% (7) 1,8% (1) | 56 | 23,7 |
| 8 | Midtjylland | 37,8% (17) 44,4% (20) 13,3% (6) 4,4% (2) | 45 | 23,8 |
| 9 | FC Flora | 33,3% (10) 46,7% (14) 13,3% (4) 6,7% (2) | 30 | 23,8 |
| 10 | Kuopio PS | 31,1% (14) 55,6% (25) 8,9% (4) 4,4% (2) | 45 | 24,0 |
| 11 | PAOK Saloniki | 38,0% (19) 40,0% (20) 18,0% (9) 4,0% (2) | 50 | 24,1 |
| 12 | D. Zagreb | 28,0% (14) 52,0% (26) 18,0% (9) 2,0% (1) | 50 | 24,2 |
| 13 | Slavia Prag | 25,0% (10) 62,5% (25) 7,5% (3) 5,0% (2) | 40 | 24,5 |
| 14 | Celje | 13,0% (3) 73,9% (17) 4,3% (1) 8,7% (2) | 23 | 24,6 |
| 15 | Y.B. Bern | 28,1% (9) 59,4% (19) 6,2% (2) 6,2% (2) | 32 | 24,6 |
| 16 | FK Buducnost | 32,1% (9) 39,3% (11) 25,0% (7) | 28 | 24,8 |
| 17 | L. Warschau | 33,3% (15) 35,6% (16) 22,2% (10) 8,9% (4) | 45 | 25,1 |
| 18 | Besiktas | 38,1% (16) 31,0% (13) 26,2% (11) 4,8% (2) | 42 | 25,1 |
| 19 | Ferencvárosi | 26,3% (10) 55,3% (21) 18,4% (7) | 38 | 25,1 |
| 20 | M. Tel Aviv | 28,9% (11) 44,7% (17) 23,7% (9) 2,6% (1) | 38 | 25,2 |
| 21 | Djurgardens | 21,1% (8) 50,0% (19) 26,3% (10) 2,6% (1) | 38 | 25,3 |
| 22 | R. S. Belgrad | 33,3% (12) 30,6% (11) 33,3% (12) | 36 | 25,3 |
| 23 | S. Tiraspol | 11,8% (4) 70,6% (24) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 25,5 |
| 24 | Molde | 16,7% (6) 55,6% (20) 27,8% (10) | 36 | 25,7 |
| 25 | D. Tiflis | 24,4% (10) 46,3% (19) 17,1% (7) 2,4% (1) | 41 | 25,7 |
| 26 | Karabakh | 18,8% (6) 50,0% (16) 28,1% (9) 3,1% (1) | 32 | 25,8 |
| 27 | Dundalk | 9,7% (3) 64,5% (20) 12,9% (4) 6,5% (2) | 31 | 25,8 |
| 28 | Astana | 28,6% (10) 34,3% (12) 20,0% (7) 5,7% (2) | 35 | 25,8 |
| 29 | Pilsen | 18,8% (6) 56,2% (18) 18,8% (6) 6,2% (2) | 32 | 25,8 |
| 30 | KAA Gent | 23,8% (10) 52,4% (22) 21,4% (9) 2,4% (1) | 42 | 25,9 |
| 31 | Olympiakos | 18,2% (8) 56,8% (25) 15,9% (7) 9,1% (4) | 44 | 25,9 |
| 32 | Riga FC | 20,8% (11) 50,9% (27) 18,9% (10) 9,4% (5) | 53 | 25,9 |
| 33 | Floriana | 8,3% (1) 75,0% (9) 8,3% (1) 8,3% (1) | 12 | 25,9 |
| 34 | Benfica | 17,0% (8) 59,6% (28) 17,0% (8) 6,4% (3) | 47 | 26,0 |
| 35 | Linfield | 22,2% (6) 51,9% (14) 14,8% (4) 11,1% (3) | 27 | 26,0 |
| 36 | FC Ararat-Arme | 16,7% (8) 58,3% (28) 18,8% (9) 6,2% (3) | 48 | 26,2 |
| 37 | Krasnodar | 23,7% (9) 39,5% (15) 28,9% (11) 7,9% (3) | 38 | 26,3 |
| 38 | FK Rigas Futbo | 16,0% (8) 54,0% (27) 20,0% (10) 10,0% (5) | 50 | 26,3 |
| 39 | Om. Nikosia | 29,4% (10) 32,4% (11) 26,5% (9) 11,8% (4) | 34 | 26,4 |
| 40 | Fola Esch | 21,9% (7) 40,6% (13) 25,0% (8) 12,5% (4) | 32 | 26,4 |
| 41 | SK SLovan | 14,7% (5) 55,9% (19) 29,4% (10) | 34 | 26,4 |
| 42 | Klaksvik | 18,5% (5) 48,1% (13) 22,2% (6) 7,4% (2) | 27 | 26,5 |
| 43 | Ludogorets | 10,5% (4) 63,2% (24) 18,4% (7) 5,3% (2) | 38 | 26,5 |
| 44 | Marijampole | 24,2% (8) 39,4% (13) 27,3% (9) 9,1% (3) | 33 | 26,6 |
| 45 | FK Sarajevo | 14,3% (3) 52,4% (11) 28,6% (6) 4,8% (1) | 21 | 26,7 |
| 46 | KF Drita | 9,1% (2) 54,5% (12) 36,4% (8) | 22 | 26,7 |
| 47 | Floriana FC | 100,0% (4) | 4 | 26,8 |
| 48 | Kratovo | 8,3% (1) 41,7% (5) 41,7% (5) | 12 | 27,2 |
| 49 | Brest | 14,8% (4) 37,0% (10) 29,6% (8) 14,8% (4) | 27 | 27,3 |
| 50 | Cluj | 21,6% (11) 39,2% (20) 23,5% (12) 15,7% (8) | 51 | 27,3 |
| 51 | FC Europa | 10,5% (2) 42,1% (8) 36,8% (7) 10,5% (2) | 19 | 27,5 |
| 52 | FK Tirana | 9,1% (2) 68,2% (15) 4,5% (1) 18,2% (4) | 22 | 27,9 |
| 53 | Connah's Quay | 12,0% (3) 40,0% (10) 32,0% (8) 16,0% (4) | 25 | 28,0 |
| 54 | KR Reykjavik | 12,5% (2) 25,0% (4) 25,0% (4) 37,5% (6) | 16 | 29,5 |
| 55 | Tre Fiori | 50,0% (7) 14,3% (2) 35,7% (5) | 14 | 29,9 |
| 56 | Inter Club de | 3,8% (2) 24,5% (13) 18,9% (10) 43,4% (23) | 53 | 31,9 |
Champions League-Qualifikation
