| 1 | NK Celje | 37,5% (6) 50,0% (8) 6,2% (1) | 16 | 22,5 |
| 2 | Rapid Wien | 48,4% (15) 38,7% (12) 9,7% (3) | 31 | 23,0 |
| 3 | Salzburg | 50,0% (18) 38,9% (14) 2,8% (1) 8,3% (3) | 36 | 23,1 |
| 4 | Alkmaar | 39,4% (13) 51,5% (17) 9,1% (3) | 33 | 23,1 |
| 5 | Dynamo Kiev | 36,2% (21) 53,4% (31) 10,3% (6) | 58 | 23,2 |
| 6 | L. Zagreb | 41,7% (25) 43,3% (26) 11,7% (7) 3,3% (2) | 60 | 23,4 |
| 7 | C. Glasgow | 31,0% (13) 59,5% (25) 9,5% (4) | 42 | 23,6 |
| 8 | FC Flora | 35,5% (11) 45,2% (14) 12,9% (4) 6,5% (2) | 31 | 23,7 |
| 9 | Midtjylland | 34,6% (18) 50,0% (26) 11,5% (6) 3,8% (2) | 52 | 23,8 |
| 10 | Celje | 16,7% (4) 75,0% (18) 8,3% (2) | 24 | 24,0 |
| 11 | PAOK Saloniki | 38,0% (19) 40,0% (20) 18,0% (9) 4,0% (2) | 50 | 24,0 |
| 12 | Kuopio PS | 26,1% (12) 56,5% (26) 8,7% (4) 4,3% (2) | 46 | 24,3 |
| 13 | Y.B. Bern | 32,4% (11) 55,9% (19) 5,9% (2) 5,9% (2) | 34 | 24,3 |
| 14 | D. Zagreb | 25,9% (14) 53,7% (29) 16,7% (9) 3,7% (2) | 54 | 24,4 |
| 15 | Slavia Prag | 28,6% (14) 59,2% (29) 8,2% (4) 4,1% (2) | 49 | 24,4 |
| 16 | R. S. Belgrad | 37,5% (15) 30,0% (12) 30,0% (12) | 40 | 24,8 |
| 17 | FK Buducnost | 32,1% (9) 39,3% (11) 25,0% (7) | 28 | 24,8 |
| 18 | M. Tel Aviv | 32,5% (13) 42,5% (17) 22,5% (9) 2,5% (1) | 40 | 24,9 |
| 19 | Ferencvárosi | 22,5% (9) 60,0% (24) 17,5% (7) | 40 | 25,2 |
| 20 | Besiktas | 36,5% (19) 32,7% (17) 26,9% (14) 3,8% (2) | 52 | 25,2 |
| 21 | Djurgardens | 21,1% (8) 50,0% (19) 26,3% (10) 2,6% (1) | 38 | 25,3 |
| 22 | D. Tiflis | 28,6% (12) 45,2% (19) 16,7% (7) 2,4% (1) | 42 | 25,4 |
| 23 | S. Tiraspol | 13,5% (5) 70,3% (26) 10,8% (4) 5,4% (2) | 37 | 25,5 |
| 24 | Molde | 18,9% (7) 54,1% (20) 27,0% (10) | 37 | 25,5 |
| 25 | L. Warschau | 31,2% (15) 35,4% (17) 20,8% (10) 12,5% (6) | 48 | 25,7 |
| 26 | Floriana | 8,3% (1) 75,0% (9) 8,3% (1) 8,3% (1) | 12 | 25,8 |
| 27 | Benfica | 17,3% (9) 61,5% (32) 15,4% (8) 5,8% (3) | 52 | 25,8 |
| 28 | Dundalk | 10,0% (3) 63,3% (19) 13,3% (4) 6,7% (2) | 30 | 25,8 |
| 29 | Olympiakos | 19,1% (9) 57,4% (27) 14,9% (7) 8,5% (4) | 47 | 25,8 |
| 30 | KAA Gent | 23,8% (10) 52,4% (22) 21,4% (9) 2,4% (1) | 42 | 25,9 |
| 31 | Astana | 25,0% (9) 38,9% (14) 19,4% (7) 5,6% (2) | 36 | 25,9 |
| 32 | Karabakh | 17,6% (6) 50,0% (17) 29,4% (10) 2,9% (1) | 34 | 25,9 |
| 33 | Pilsen | 16,7% (6) 55,6% (20) 22,2% (8) 5,6% (2) | 36 | 26,0 |
| 34 | FC Ararat-Arme | 18,0% (9) 58,0% (29) 18,0% (9) 6,0% (3) | 50 | 26,1 |
| 35 | Fola Esch | 23,5% (8) 41,2% (14) 23,5% (8) 11,8% (4) | 34 | 26,1 |
| 36 | Riga FC | 20,4% (11) 48,1% (26) 20,4% (11) 11,1% (6) | 54 | 26,2 |
| 37 | FK Rigas Futbo | 15,7% (8) 56,9% (29) 17,6% (9) 9,8% (5) | 51 | 26,2 |
| 38 | Krasnodar | 23,1% (9) 41,0% (16) 28,2% (11) 7,7% (3) | 39 | 26,2 |
| 39 | Om. Nikosia | 28,6% (10) 34,3% (12) 25,7% (9) 11,4% (4) | 35 | 26,3 |
| 40 | Linfield | 21,4% (6) 46,4% (13) 17,9% (5) 10,7% (3) | 28 | 26,3 |
| 41 | SK SLovan | 14,7% (5) 58,8% (20) 26,5% (9) | 34 | 26,3 |
| 42 | KF Drita | 8,7% (2) 56,5% (13) 34,8% (8) | 23 | 26,5 |
| 43 | Ludogorets | 9,8% (4) 63,4% (26) 19,5% (8) 4,9% (2) | 41 | 26,5 |
| 44 | Marijampole | 25,0% (8) 37,5% (12) 28,1% (9) 9,4% (3) | 32 | 26,7 |
| 45 | Floriana FC | 100,0% (4) | 4 | 26,8 |
| 46 | Klaksvik | 15,4% (4) 50,0% (13) 23,1% (6) 7,7% (2) | 26 | 26,8 |
| 47 | FC Europa | 14,3% (3) 42,9% (9) 33,3% (7) 9,5% (2) | 21 | 27,0 |
| 48 | FK Sarajevo | 10,5% (2) 52,6% (10) 31,6% (6) 5,3% (1) | 19 | 27,1 |
| 49 | Brest | 14,3% (4) 39,3% (11) 28,6% (8) 14,3% (4) | 28 | 27,1 |
| 50 | Kratovo | 9,1% (1) 36,4% (4) 45,5% (5) | 11 | 27,2 |
| 51 | Cluj | 18,9% (10) 39,6% (21) 26,4% (14) 15,1% (8) | 53 | 27,5 |
| 52 | Connah's Quay | 12,0% (3) 40,0% (10) 32,0% (8) 16,0% (4) | 25 | 28,0 |
| 53 | FK Tirana | 9,5% (2) 66,7% (14) 4,8% (1) 19,0% (4) | 21 | 28,1 |
| 54 | KR Reykjavik | 12,5% (2) 25,0% (4) 25,0% (4) 37,5% (6) | 16 | 29,5 |
| 55 | Tre Fiori | 50,0% (7) 14,3% (2) 35,7% (5) | 14 | 29,9 |
| 56 | Inter Club de | 3,8% (2) 23,1% (12) 19,2% (10) 44,2% (23) | 52 | 32,1 |
Champions League-Qualifikation
