| Pl. | Mannschaft | Sp. | Goals | Diff. | Pts | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Mariners | 27 | 49:27 | 22 | 55 | |
| 2 | Wellington | 27 | 42:26 | 16 | 53 | |
| 3 | Mel. Victory | 27 | 43:33 | 10 | 42 | |
| 4 | Sydney FC | 27 | 52:41 | 11 | 41 | |
| 5 | Macarthur FC | 27 | 45:48 | -3 | 41 | |
| 6 | Melbourne City | 27 | 50:38 | 12 | 39 | |
| 7 | Wanderers FC | 27 | 44:48 | -4 | 37 | |
| 8 | Adelaide | 27 | 52:53 | -1 | 32 | |
| 9 | Brisbane Roar | 27 | 42:55 | -13 | 30 | |
| 10 | Jets FC | 27 | 39:47 | -8 | 28 | |
| 11 | FC Western Uni | 27 | 36:55 | -19 | 26 | |
| 12 | Perth Glory | 27 | 46:69 | -23 | 22 |
Der Pfau, der Superpfau, der Herr Effenberg. Da stolziert er über den Platz und dann verschießt er, es gibt doch noch einen Fußballgott.
— Andreas Herzog nach dem Pokalsieg 1999