| 1 | FK Panevezys | 50,0% (1) 50,0% (1) | 2 | 19,0 |
| 2 | FK Buducnost | 72,7% (8) 27,3% (3) | 11 | 20,7 |
| 3 | Sestaponi | 62,5% (5) 37,5% (3) | 8 | 21,0 |
| 4 | Z. Sarajevo | 50,0% (9) 50,0% (9) | 18 | 21,1 |
| 5 | FC Flora | 60,0% (12) 35,0% (7) 5,0% (1) | 20 | 21,5 |
| 6 | RSC Anderlecht | 50,0% (21) 42,9% (18) 7,1% (3) | 42 | 21,6 |
| 7 | Panathinaikos | 58,3% (14) 37,5% (9) 4,2% (1) | 24 | 21,8 |
| 8 | Molde | 57,1% (16) 28,6% (8) 10,7% (3) 3,6% (1) | 28 | 22,1 |
| 9 | S. Tiraspol | 45,0% (9) 55,0% (11) | 20 | 22,2 |
| 10 | HJK Helsinki | 40,0% (10) 44,0% (11) 16,0% (4) | 25 | 22,2 |
| 11 | Feyenoord | 50,0% (14) 42,9% (12) 7,1% (2) | 28 | 22,2 |
| 12 | P. Belgrad | 50,0% (16) 43,8% (14) 3,1% (1) 3,1% (1) | 32 | 22,4 |
| 13 | D. Zagreb | 48,9% (23) 36,2% (17) 6,4% (3) 6,4% (3) | 47 | 22,4 |
| 14 | Zilina | 47,1% (8) 47,1% (8) 5,9% (1) | 17 | 22,5 |
| 15 | Udinese | 44,6% (29) 44,6% (29) 7,7% (5) 3,1% (2) | 65 | 22,9 |
| 16 | C. Glasgow | 47,1% (16) 47,1% (16) 5,9% (2) | 34 | 23,1 |
| 17 | Braga | 30,6% (11) 63,9% (23) 5,6% (2) | 36 | 23,1 |
| 18 | Club Brügge | 47,8% (11) 43,5% (10) 4,3% (1) 4,3% (1) | 23 | 23,2 |
| 19 | Maribor | 33,3% (10) 53,3% (16) 6,7% (2) 3,3% (1) | 30 | 23,8 |
| 20 | Motherwell | 50,0% (5) 20,0% (2) 30,0% (3) | 10 | 23,8 |
| 21 | FC Basel | 38,7% (12) 45,2% (14) 12,9% (4) 3,2% (1) | 31 | 23,8 |
| 22 | B36 Torshavn | 36,4% (4) 45,5% (5) 18,2% (2) | 11 | 23,9 |
| 23 | Ventspils | 100,0% (8) | 8 | 24,0 |
| 24 | Ekranas | 50,0% (6) 25,0% (3) 16,7% (2) 8,3% (1) | 12 | 24,1 |
| 25 | Dynamo Kiev | 20,6% (14) 52,9% (36) 7,4% (5) 2,9% (2) | 68 | 24,2 |
| 26 | Linfield | 30,8% (4) 53,8% (7) 15,4% (2) | 13 | 24,3 |
| 27 | Salzburg | 37,8% (14) 45,9% (17) 8,1% (3) 8,1% (3) | 37 | 24,4 |
| 28 | Debrecen | 16,7% (2) 66,7% (8) 16,7% (2) | 12 | 24,4 |
| 29 | N. Baku | 37,0% (10) 37,0% (10) 11,1% (3) 11,1% (3) | 27 | 24,5 |
| 30 | Cluj | 21,1% (4) 68,4% (13) 10,5% (2) | 19 | 24,5 |
| 31 | Vaslui | 15,4% (2) 76,9% (10) 7,7% (1) | 13 | 24,5 |
| 32 | V. Skopje | 14,3% (1) 71,4% (5) 14,3% (1) | 7 | 24,6 |
| 33 | Qaraghandy | 26,1% (6) 56,5% (13) 17,4% (4) | 23 | 24,7 |
| 34 | Lille | 31,4% (11) 42,9% (15) 22,9% (8) 2,9% (1) | 35 | 24,8 |
| 35 | M'gladbach | 29,6% (8) 44,4% (12) 18,5% (5) 7,4% (2) | 27 | 24,9 |
| 36 | Ulisses | 100,0% (3) | 3 | 25,0 |
| 37 | Valletta | 100,0% (1) | 1 | 25,0 |
| 38 | Spartak Moskau | 22,2% (10) 57,8% (26) 13,3% (6) 4,4% (2) | 45 | 25,0 |
| 39 | Kopenhagen | 31,0% (9) 41,4% (12) 27,6% (8) | 29 | 25,1 |
| 40 | Malaga | 26,1% (6) 43,5% (10) 30,4% (7) | 23 | 25,1 |
| 41 | Liberec | 26,3% (5) 57,9% (11) 10,5% (2) 5,3% (1) | 19 | 25,2 |
| 42 | Korça | 40,0% (4) 30,0% (3) 10,0% (1) 20,0% (2) | 10 | 25,2 |
| 43 | Llansantffraid | 22,2% (4) 55,6% (10) 11,1% (2) 11,1% (2) | 18 | 25,2 |
| 44 | Ludogorets | 10,0% (2) 75,0% (15) 15,0% (3) | 20 | 25,3 |
| 45 | KR Reykjavik | 20,0% (3) 60,0% (9) 6,7% (1) 13,3% (2) | 15 | 25,3 |
| 46 | Shmona | 25,8% (8) 38,7% (12) 19,4% (6) 6,5% (2) | 31 | 25,4 |
| 47 | Shamrock | 80,0% (8) 10,0% (1) | 10 | 25,9 |
| 48 | BATE | 16,7% (4) 54,2% (13) 25,0% (6) 4,2% (1) | 24 | 26,0 |
| 49 | Dudelange | 8,3% (1) 66,7% (8) 25,0% (3) | 12 | 26,1 |
| 50 | AEL Limassol | 28,0% (7) 28,0% (7) 36,0% (9) 4,0% (1) | 25 | 26,1 |
| 51 | Helsingborg | 30,0% (9) 33,3% (10) 20,0% (6) 16,7% (5) | 30 | 26,2 |
| 52 | Fenerbahce | 20,0% (6) 40,0% (12) 36,7% (11) 3,3% (1) | 30 | 26,5 |
| 53 | Tre Penne | 11,1% (1) 44,4% (4) 33,3% (3) 11,1% (1) | 9 | 27,1 |
| 54 | Wroclaw | 13,6% (6) 38,6% (17) 15,9% (7) 2,3% (1) | 44 | 28,1 |
| 55 | Lusitanos | 62,5% (5) 12,5% (1) 25,0% (2) | 8 | 28,9 |
Champions League-Qualifikation
