| 1 | Pjunik | 50,0% (10) 50,0% (10) | 20 | 21,8 |
| 2 | L. Tallinn | 55,0% (22) 37,5% (15) 7,5% (3) | 40 | 21,9 |
| 3 | Malmö FF | 36,7% (22) 35,0% (21) 5,0% (3) 1,7% (1) | 60 | 22,0 |
| 4 | HJK Helsinki | 58,8% (20) 23,5% (8) 14,7% (5) 2,9% (1) | 34 | 22,1 |
| 5 | Trencin | 41,2% (7) 58,8% (10) | 17 | 22,1 |
| 6 | Ajax Amsterdam | 62,0% (31) 30,0% (15) 2,0% (1) 6,0% (3) | 50 | 22,2 |
| 7 | D. Zagreb | 50,0% (25) 40,0% (20) 10,0% (5) | 50 | 22,5 |
| 8 | Monaco | 54,8% (23) 33,3% (14) 11,9% (5) | 42 | 22,5 |
| 9 | Sparta Prag | 55,3% (26) 27,7% (13) 10,6% (5) 6,4% (3) | 47 | 22,6 |
| 10 | B36 Torshavn | 38,9% (7) 50,0% (9) 11,1% (2) | 18 | 22,7 |
| 11 | Midtjylland | 50,0% (17) 35,3% (12) 11,8% (4) 2,9% (1) | 34 | 22,9 |
| 12 | C. Glasgow | 42,9% (18) 40,5% (17) 16,7% (7) | 42 | 23,1 |
| 13 | Rapid Wien | 34,8% (8) 47,8% (11) 8,7% (2) 4,3% (1) | 23 | 23,2 |
| 14 | BATE | 42,5% (17) 40,0% (16) 17,5% (7) | 40 | 23,3 |
| 15 | Man. United | 40,9% (18) 45,5% (20) 11,4% (5) 2,3% (1) | 44 | 23,3 |
| 16 | Salzburg | 43,8% (14) 37,5% (12) 15,6% (5) 3,1% (1) | 32 | 23,5 |
| 17 | Sporting | 32,7% (17) 55,8% (29) 11,5% (6) | 52 | 23,5 |
| 18 | Y.B. Bern | 47,1% (16) 32,4% (11) 20,6% (7) | 34 | 23,5 |
| 19 | Lazio Rom | 44,9% (22) 34,7% (17) 20,4% (10) | 49 | 23,6 |
| 20 | Valencia | 25,5% (12) 59,6% (28) 14,9% (7) | 47 | 23,8 |
| 21 | FC Basel | 29,4% (10) 58,8% (20) 8,8% (3) 2,9% (1) | 34 | 23,9 |
| 22 | KF Skënderbe | 28,6% (2) 57,1% (4) 14,3% (1) | 7 | 23,9 |
| 23 | P. Belgrad | 34,3% (12) 54,3% (19) 8,6% (3) 2,9% (1) | 35 | 23,9 |
| 24 | Poznan | 42,9% (12) 35,7% (10) 21,4% (6) | 28 | 24,0 |
| 25 | Ludogorets | 28,6% (8) 57,1% (16) 14,3% (4) | 28 | 24,1 |
| 26 | FK Sarajevo | 26,9% (7) 53,8% (14) 19,2% (5) | 26 | 24,1 |
| 27 | M. Tel Aviv | 37,8% (14) 43,2% (16) 13,5% (5) 5,4% (2) | 37 | 24,2 |
| 28 | Leverkusen | 35,3% (12) 50,0% (17) 8,8% (3) 5,9% (2) | 34 | 24,3 |
| 29 | Club Brügge | 26,7% (8) 63,3% (19) 6,7% (2) 3,3% (1) | 30 | 24,3 |
| 30 | Fola Esch | 29,4% (5) 58,8% (10) 11,8% (2) | 17 | 24,5 |
| 31 | Zalgiris | 27,8% (10) 52,8% (19) 16,7% (6) | 36 | 24,6 |
| 32 | Pljevlja | 20,0% (2) 70,0% (7) 10,0% (1) | 10 | 24,6 |
| 33 | Lincoln FC | 25,0% (5) 40,0% (8) 15,0% (3) 10,0% (2) | 20 | 24,8 |
| 34 | Shakhtar | 28,6% (18) 46,0% (29) 19,0% (12) 3,2% (2) | 63 | 24,9 |
| 35 | Maribor | 26,5% (9) 44,1% (15) 23,5% (8) 5,9% (2) | 34 | 25,0 |
| 36 | Panathinaikos | 12,9% (4) 67,7% (21) 16,1% (5) 3,2% (1) | 31 | 25,1 |
| 37 | Astana | 16,7% (5) 50,0% (15) 16,7% (5) 3,3% (1) | 30 | 25,1 |
| 38 | Dundalk | 23,8% (5) 52,4% (11) 14,3% (3) 9,5% (2) | 21 | 25,1 |
| 39 | Fenerbahce | 30,3% (10) 45,5% (15) 21,2% (7) 3,0% (1) | 33 | 25,2 |
| 40 | Apoel FC | 32,4% (12) 32,4% (12) 32,4% (12) 2,7% (1) | 37 | 25,3 |
| 41 | Stjarnan | 22,7% (5) 45,5% (10) 27,3% (6) 4,5% (1) | 22 | 25,4 |
| 42 | Paola | 34,8% (8) 21,7% (5) 34,8% (8) 8,7% (2) | 23 | 25,4 |
| 43 | Pilsen | 30,0% (9) 43,3% (13) 23,3% (7) 3,3% (1) | 30 | 25,5 |
| 44 | V. Skopje | 30,4% (7) 39,1% (9) 26,1% (6) 4,3% (1) | 23 | 25,5 |
| 45 | Videoton | 13,3% (4) 70,0% (21) 16,7% (5) | 30 | 25,6 |
| 46 | Ventspils | 20,0% (6) 56,7% (17) 13,3% (4) 10,0% (3) | 30 | 25,7 |
| 47 | FC Dila Gori | 25,0% (3) 41,7% (5) 25,0% (3) 8,3% (1) | 12 | 26,0 |
| 48 | Karabakh | 8,0% (2) 68,0% (17) 20,0% (5) 4,0% (1) | 25 | 26,0 |
| 49 | Orhei | 15,0% (3) 60,0% (12) 25,0% (5) | 20 | 26,1 |
| 50 | Santa Coloma | 20,0% (1) 60,0% (3) 20,0% (1) | 5 | 26,2 |
| 51 | Llansantffraid | 7,1% (1) 64,3% (9) 28,6% (4) | 14 | 26,5 |
| 52 | Crusaders | 8,3% (1) 66,7% (8) 25,0% (3) | 12 | 26,6 |
| 53 | Steaua | 14,8% (4) 63,0% (17) 18,5% (5) 3,7% (1) | 27 | 26,6 |
| 54 | Folgore | 61,5% (8) 30,8% (4) 7,7% (1) | 13 | 27,1 |
| 55 | ZSKA Moskau | 22,2% (6) 40,7% (11) 22,2% (6) 14,8% (4) | 27 | 27,2 |
| 56 | Molde | 30,4% (14) 30,4% (14) 4,3% (2) 8,7% (4) | 46 | 27,8 |
| 57 | Sta Coloma | 16,7% (4) 41,7% (10) 25,0% (6) 16,7% (4) | 24 | 28,0 |
| 58 | Korça | 9,4% (3) 18,8% (6) 12,5% (4) 6,2% (2) | 32 | 28,7 |
Champions League-Qualifikation
