| 1 | Pjunik | 52,4% (11) 47,6% (10) | 21 | 21,8 |
| 2 | HJK Helsinki | 60,0% (21) 22,9% (8) 14,3% (5) 2,9% (1) | 35 | 21,9 |
| 3 | L. Tallinn | 52,5% (21) 40,0% (16) 7,5% (3) | 40 | 21,9 |
| 4 | Malmö FF | 37,7% (23) 34,4% (21) 4,9% (3) 1,6% (1) | 61 | 21,9 |
| 5 | Ajax Amsterdam | 62,7% (32) 29,4% (15) 2,0% (1) 5,9% (3) | 51 | 22,1 |
| 6 | Trencin | 38,9% (7) 61,1% (11) | 18 | 22,3 |
| 7 | Monaco | 54,3% (25) 34,8% (16) 10,9% (5) | 46 | 22,4 |
| 8 | Sparta Prag | 54,2% (26) 31,2% (15) 8,3% (4) 6,2% (3) | 48 | 22,4 |
| 9 | D. Zagreb | 51,8% (29) 37,5% (21) 10,7% (6) | 56 | 22,4 |
| 10 | Midtjylland | 52,8% (19) 33,3% (12) 11,1% (4) 2,8% (1) | 36 | 22,7 |
| 11 | B36 Torshavn | 38,9% (7) 50,0% (9) 11,1% (2) | 18 | 22,7 |
| 12 | Rapid Wien | 36,0% (9) 48,0% (12) 8,0% (2) 4,0% (1) | 25 | 23,0 |
| 13 | Man. United | 43,5% (20) 43,5% (20) 10,9% (5) 2,2% (1) | 46 | 23,2 |
| 14 | Salzburg | 44,4% (16) 38,9% (14) 13,9% (5) 2,8% (1) | 36 | 23,3 |
| 15 | BATE | 42,5% (17) 40,0% (16) 17,5% (7) | 40 | 23,3 |
| 16 | C. Glasgow | 37,5% (15) 45,0% (18) 17,5% (7) | 40 | 23,4 |
| 17 | Y.B. Bern | 47,2% (17) 33,3% (12) 19,4% (7) | 36 | 23,5 |
| 18 | KF Skënderbe | 37,5% (3) 50,0% (4) 12,5% (1) | 8 | 23,5 |
| 19 | Lazio Rom | 45,1% (23) 35,3% (18) 19,6% (10) | 51 | 23,5 |
| 20 | Sporting | 32,7% (18) 56,4% (31) 10,9% (6) | 55 | 23,5 |
| 21 | FC Basel | 35,3% (12) 52,9% (18) 8,8% (3) 2,9% (1) | 34 | 23,7 |
| 22 | Valencia | 27,1% (13) 58,3% (28) 14,6% (7) | 48 | 23,7 |
| 23 | P. Belgrad | 34,2% (13) 55,3% (21) 7,9% (3) 2,6% (1) | 38 | 23,8 |
| 24 | Leverkusen | 38,9% (14) 47,2% (17) 8,3% (3) 5,6% (2) | 36 | 24,0 |
| 25 | FK Sarajevo | 26,9% (7) 53,8% (14) 19,2% (5) | 26 | 24,1 |
| 26 | Ludogorets | 27,6% (8) 58,6% (17) 13,8% (4) | 29 | 24,1 |
| 27 | M. Tel Aviv | 38,5% (15) 43,6% (17) 12,8% (5) 5,1% (2) | 39 | 24,2 |
| 28 | Club Brügge | 25,8% (8) 64,5% (20) 6,5% (2) 3,2% (1) | 31 | 24,2 |
| 29 | Fola Esch | 33,3% (6) 55,6% (10) 11,1% (2) | 18 | 24,3 |
| 30 | Zalgiris | 27,8% (10) 52,8% (19) 16,7% (6) | 36 | 24,6 |
| 31 | Pljevlja | 20,0% (2) 70,0% (7) 10,0% (1) | 10 | 24,6 |
| 32 | Maribor | 27,8% (10) 44,4% (16) 22,2% (8) 5,6% (2) | 36 | 24,8 |
| 33 | Shakhtar | 29,7% (19) 45,3% (29) 18,8% (12) 3,1% (2) | 64 | 24,9 |
| 34 | Lincoln FC | 28,6% (6) 42,9% (9) 19,0% (4) 9,5% (2) | 21 | 24,9 |
| 35 | Fenerbahce | 28,6% (10) 48,6% (17) 20,0% (7) 2,9% (1) | 35 | 25,0 |
| 36 | Panathinaikos | 12,5% (4) 68,8% (22) 15,6% (5) 3,1% (1) | 32 | 25,1 |
| 37 | Astana | 15,6% (5) 53,1% (17) 15,6% (5) 3,1% (1) | 32 | 25,1 |
| 38 | Dundalk | 23,8% (5) 52,4% (11) 14,3% (3) 9,5% (2) | 21 | 25,1 |
| 39 | V. Skopje | 32,0% (8) 40,0% (10) 24,0% (6) 4,0% (1) | 25 | 25,2 |
| 40 | Apoel FC | 32,4% (12) 32,4% (12) 32,4% (12) 2,7% (1) | 37 | 25,3 |
| 41 | Stjarnan | 22,7% (5) 45,5% (10) 27,3% (6) 4,5% (1) | 22 | 25,4 |
| 42 | Paola | 34,8% (8) 21,7% (5) 34,8% (8) 8,7% (2) | 23 | 25,4 |
| 43 | Poznan | 41,2% (14) 35,3% (12) 17,6% (6) 5,9% (2) | 34 | 25,5 |
| 44 | Pilsen | 29,0% (9) 45,2% (14) 22,6% (7) 3,2% (1) | 31 | 25,5 |
| 45 | Videoton | 13,3% (4) 70,0% (21) 16,7% (5) | 30 | 25,6 |
| 46 | Ventspils | 20,0% (6) 56,7% (17) 13,3% (4) 10,0% (3) | 30 | 25,7 |
| 47 | Karabakh | 8,0% (2) 68,0% (17) 20,0% (5) 4,0% (1) | 25 | 26,0 |
| 48 | Orhei | 15,0% (3) 60,0% (12) 25,0% (5) | 20 | 26,1 |
| 49 | Santa Coloma | 20,0% (1) 60,0% (3) 20,0% (1) | 5 | 26,2 |
| 50 | Steaua | 12,5% (4) 68,8% (22) 15,6% (5) 3,1% (1) | 32 | 26,4 |
| 51 | FC Dila Gori | 18,2% (2) 45,5% (5) 27,3% (3) 9,1% (1) | 11 | 26,5 |
| 52 | Llansantffraid | 7,1% (1) 64,3% (9) 28,6% (4) | 14 | 26,5 |
| 53 | Crusaders | 8,3% (1) 66,7% (8) 25,0% (3) | 12 | 26,6 |
| 54 | Folgore | 64,3% (9) 28,6% (4) 7,1% (1) | 14 | 26,9 |
| 55 | ZSKA Moskau | 19,4% (6) 41,9% (13) 19,4% (6) 19,4% (6) | 31 | 27,5 |
| 56 | Molde | 31,9% (15) 29,8% (14) 4,3% (2) 8,5% (4) | 47 | 27,6 |
| 57 | Sta Coloma | 16,0% (4) 44,0% (11) 24,0% (6) 16,0% (4) | 25 | 27,8 |
| 58 | Korça | 8,6% (3) 25,7% (9) 11,4% (4) 5,7% (2) | 35 | 27,9 |
Champions League-Qualifikation
