| 1 | Ajax Amsterdam | 70,2% (40) 17,5% (10) 7,0% (4) 5,3% (3) | 57 | 22,1 |
| 2 | Midtjylland | 45,3% (24) 41,5% (22) 9,4% (5) 3,8% (2) | 53 | 22,4 |
| 3 | FC Basel | 46,2% (18) 38,5% (15) 15,4% (6) | 39 | 22,6 |
| 4 | FC Flora | 37,1% (13) 45,7% (16) 8,6% (3) 8,6% (3) | 35 | 22,9 |
| 5 | Cork | 33,3% (12) 52,8% (19) 5,6% (2) | 36 | 22,9 |
| 6 | Y.B. Bern | 28,6% (8) 64,3% (18) 3,6% (1) 3,6% (1) | 28 | 22,9 |
| 7 | Salzburg | 54,5% (18) 33,3% (11) 6,1% (2) 6,1% (2) | 33 | 23,1 |
| 8 | Eindhoven | 45,3% (24) 37,7% (20) 9,4% (5) 5,7% (3) | 53 | 23,1 |
| 9 | Spartak Moskau | 46,3% (19) 43,9% (18) 4,9% (2) 4,9% (2) | 41 | 23,1 |
| 10 | Dynamo Kiev | 37,2% (16) 46,5% (20) 11,6% (5) | 43 | 23,5 |
| 11 | HJK Helsinki | 46,2% (18) 35,9% (14) 15,4% (6) 2,6% (1) | 39 | 23,6 |
| 12 | C. Glasgow | 41,3% (19) 43,5% (20) 8,7% (4) 6,5% (3) | 46 | 23,7 |
| 13 | Rosenborg BK | 42,1% (16) 36,8% (14) 18,4% (7) 2,6% (1) | 38 | 23,8 |
| 14 | D. Zagreb | 37,8% (14) 45,9% (17) 16,2% (6) | 37 | 23,9 |
| 15 | Trnava | 29,6% (8) 51,9% (14) 14,8% (4) 3,7% (1) | 27 | 23,9 |
| 16 | O. Ljubljana | 33,3% (12) 61,1% (22) 5,6% (2) | 36 | 23,9 |
| 17 | Slavia Prag | 33,3% (13) 51,3% (20) 15,4% (6) | 39 | 24,1 |
| 18 | Jurmala | 45,7% (16) 25,7% (9) 22,9% (8) 5,7% (2) | 35 | 24,2 |
| 19 | H. Valletta | 43,8% (14) 25,0% (8) 28,1% (9) 3,1% (1) | 32 | 24,3 |
| 20 | Benfica | 30,2% (16) 52,8% (28) 13,2% (7) 3,8% (2) | 53 | 24,3 |
| 21 | Malmö FF | 48,8% (20) 24,4% (10) 17,1% (7) 7,3% (3) | 41 | 24,4 |
| 22 | AEK Athen | 33,3% (14) 50,0% (21) 16,7% (7) | 42 | 24,4 |
| 23 | R. S. Belgrad | 27,3% (12) 52,3% (23) 18,2% (8) | 44 | 24,5 |
| 24 | Sturm Graz | 27,5% (11) 55,0% (22) 17,5% (7) | 40 | 24,5 |
| 25 | Apoel FC | 31,6% (12) 36,8% (14) 23,7% (9) 7,9% (3) | 38 | 24,8 |
| 26 | Sutjeska | 25,0% (8) 53,1% (17) 18,8% (6) 3,1% (1) | 32 | 24,9 |
| 27 | Kutaisi | 30,4% (7) 47,8% (11) 8,7% (2) 8,7% (2) | 23 | 25,0 |
| 28 | PAOK Saloniki | 30,4% (14) 37,0% (17) 30,4% (14) 2,2% (1) | 46 | 25,1 |
| 29 | Tetovo | 20,0% (7) 54,3% (19) 25,7% (9) | 35 | 25,1 |
| 30 | Llansantffraid | 32,0% (8) 32,0% (8) 28,0% (7) 4,0% (1) | 25 | 25,2 |
| 31 | FK Sutjeska Fo | 28,6% (4) 42,9% (6) 21,4% (3) 7,1% (1) | 14 | 25,2 |
| 32 | L. Warschau | 27,9% (12) 46,5% (20) 16,3% (7) 9,3% (4) | 43 | 25,3 |
| 33 | BATE | 19,4% (6) 48,4% (15) 29,0% (9) 3,2% (1) | 31 | 25,3 |
| 34 | Lüttich | 14,3% (5) 65,7% (23) 17,1% (6) 2,9% (1) | 35 | 25,3 |
| 35 | Fehervar | 18,2% (4) 59,1% (13) 18,2% (4) 4,5% (1) | 22 | 25,5 |
| 36 | Mostar | 17,9% (5) 50,0% (14) 28,6% (8) 3,6% (1) | 28 | 25,8 |
| 37 | Fenerbahce | 28,3% (13) 37,0% (17) 26,1% (12) 8,7% (4) | 46 | 25,8 |
| 38 | Valur | 18,8% (6) 56,2% (18) 12,5% (4) 12,5% (4) | 32 | 25,8 |
| 39 | S. Tiraspol | 15,6% (5) 56,2% (18) 21,9% (7) 6,2% (2) | 32 | 25,9 |
| 40 | Astana | 22,5% (9) 27,5% (11) 35,0% (14) 5,0% (2) | 40 | 25,9 |
| 41 | KF Drita | 12,5% (3) 66,7% (16) 16,7% (4) 4,2% (1) | 24 | 26,0 |
| 42 | Göta | 26,1% (6) 34,8% (8) 21,7% (5) 17,4% (4) | 23 | 26,3 |
| 43 | Crusaders | 20,6% (7) 38,2% (13) 32,4% (11) 8,8% (3) | 34 | 26,5 |
| 44 | Karabakh | 15,4% (4) 50,0% (13) 34,6% (9) | 26 | 26,5 |
| 45 | Ludogorets | 16,7% (6) 38,9% (14) 33,3% (12) 8,3% (3) | 36 | 26,6 |
| 46 | Dudelange | 18,8% (6) 40,6% (13) 34,4% (11) 6,2% (2) | 32 | 26,7 |
| 47 | Cluj | 23,8% (10) 42,9% (18) 23,8% (10) 9,5% (4) | 42 | 26,7 |
| 48 | Beer Sheva | 11,1% (4) 55,6% (20) 27,8% (10) 5,6% (2) | 36 | 26,9 |
| 49 | Videoton | 19,2% (5) 42,3% (11) 26,9% (7) 11,5% (3) | 26 | 26,9 |
| 50 | KS Kukesi | 11,8% (4) 50,0% (17) 29,4% (10) 8,8% (3) | 34 | 27,1 |
| 51 | Lincoln FC | 11,5% (3) 46,2% (12) 30,8% (8) 11,5% (3) | 26 | 27,1 |
| 52 | Martuni | 6,1% (2) 51,5% (17) 39,4% (13) 3,0% (1) | 33 | 27,1 |
| 53 | Marijampole | 10,0% (3) 46,7% (14) 40,0% (12) 3,3% (1) | 30 | 27,4 |
| 54 | Valletta | 9,1% (1) 54,5% (6) 36,4% (4) | 11 | 27,5 |
| 55 | Sta Coloma | 11,1% (4) 38,9% (14) 25,0% (9) 22,2% (8) | 36 | 28,8 |
| 56 | Santa Coloma | 57,1% (4) 14,3% (1) 28,6% (2) | 7 | 30,1 |
| 57 | SP La Fiorit | 11,4% (4) 34,3% (12) 22,9% (8) 31,4% (11) | 35 | 30,2 |
Champions League-Qualifikation
