| 1 | Salzburg | 54,8% (23) 38,1% (16) 7,1% (3) | 42 | 22,5 |
| 2 | Kairat | 55,2% (16) 27,6% (8) 13,8% (4) 3,4% (1) | 29 | 23,2 |
| 3 | NK Mura | 40,6% (13) 43,8% (14) 12,5% (4) 3,1% (1) | 32 | 23,3 |
| 4 | Rapid Wien | 48,6% (18) 29,7% (11) 18,9% (7) | 37 | 23,4 |
| 5 | FC Flora | 47,1% (16) 35,3% (12) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 23,4 |
| 6 | Midtjylland | 41,3% (19) 45,7% (21) 8,7% (4) 4,3% (2) | 46 | 23,6 |
| 7 | Bodö/Glimt | 31,6% (12) 55,3% (21) 13,2% (5) | 38 | 23,6 |
| 8 | Eindhoven | 48,6% (18) 37,8% (14) 8,1% (3) 5,4% (2) | 37 | 23,8 |
| 9 | Shakhtar | 25,0% (14) 62,5% (35) 10,7% (6) 1,8% (1) | 56 | 23,9 |
| 10 | Spartak Moskau | 37,0% (17) 52,2% (24) 6,5% (3) 4,3% (2) | 46 | 24,0 |
| 11 | FK Buducnost | 40,0% (12) 33,3% (10) 13,3% (4) 6,7% (2) | 30 | 24,1 |
| 12 | Genk | 33,3% (12) 52,8% (19) 11,1% (4) 2,8% (1) | 36 | 24,1 |
| 13 | FC Prishtina | 30,6% (11) 52,8% (19) 8,3% (3) 5,6% (2) | 36 | 24,1 |
| 14 | D. Zagreb | 31,5% (17) 50,0% (27) 13,0% (7) 3,7% (2) | 54 | 24,2 |
| 15 | Bröndby IF | 29,0% (9) 58,1% (18) 9,7% (3) 3,2% (1) | 31 | 24,4 |
| 16 | Y.B. Bern | 25,7% (9) 62,9% (22) 5,7% (2) 5,7% (2) | 35 | 24,5 |
| 17 | Malmö FF | 41,7% (20) 33,3% (16) 12,5% (6) 12,5% (6) | 48 | 24,5 |
| 18 | M. Haifa | 26,8% (15) 55,4% (31) 14,3% (8) 3,6% (2) | 56 | 24,6 |
| 19 | Monaco | 31,7% (13) 46,3% (19) 12,2% (5) 9,8% (4) | 41 | 24,6 |
| 20 | HB Torshavn | 26,5% (9) 55,9% (19) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 24,7 |
| 21 | C. Glasgow | 25,0% (11) 54,5% (24) 18,2% (8) 2,3% (1) | 44 | 24,7 |
| 22 | S. Tiraspol | 25,0% (10) 65,0% (26) 5,0% (2) 5,0% (2) | 40 | 24,8 |
| 23 | Sparta Prag | 21,7% (10) 54,3% (25) 19,6% (9) 2,2% (1) | 46 | 24,8 |
| 24 | Banja Luka | 34,5% (10) 41,4% (12) 17,2% (5) 6,9% (2) | 29 | 24,9 |
| 25 | L. Warschau | 34,1% (15) 40,9% (18) 18,2% (8) 6,8% (3) | 44 | 25,0 |
| 26 | HJK Helsinki | 30,2% (13) 39,5% (17) 20,9% (9) 9,3% (4) | 43 | 25,0 |
| 27 | D. Tiflis | 24,4% (10) 43,9% (18) 19,5% (8) 2,4% (1) | 41 | 25,0 |
| 28 | Slavia Prag | 28,3% (15) 45,3% (24) 20,8% (11) 5,7% (3) | 53 | 25,2 |
| 29 | Saligorsk | 16,1% (5) 58,1% (18) 16,1% (5) 6,5% (2) | 31 | 25,5 |
| 30 | Fola Esch | 27,5% (11) 40,0% (16) 20,0% (8) 12,5% (5) | 40 | 25,6 |
| 31 | N. Baku | 25,0% (7) 46,4% (13) 21,4% (6) 7,1% (2) | 28 | 25,7 |
| 32 | Tetovo | 20,6% (7) 58,8% (20) 11,8% (4) 8,8% (3) | 34 | 25,8 |
| 33 | R. S. Belgrad | 30,2% (13) 27,9% (12) 32,6% (14) 4,7% (2) | 43 | 25,8 |
| 34 | Durres | 41,4% (12) 31,0% (9) 6,9% (2) 17,2% (5) | 29 | 25,9 |
| 35 | Galatasaray | 27,6% (16) 44,8% (26) 15,5% (9) 12,1% (7) | 58 | 26,2 |
| 36 | Gl. Rangers | 25,6% (11) 39,5% (17) 18,6% (8) 14,0% (6) | 43 | 26,2 |
| 37 | Ferencvárosi | 16,2% (6) 59,5% (22) 21,6% (8) 2,7% (1) | 37 | 26,2 |
| 38 | Ludogorets | 16,3% (7) 51,2% (22) 23,3% (10) 4,7% (2) | 43 | 26,2 |
| 39 | FK Rigas Futbo | 7,0% (3) 62,8% (27) 25,6% (11) 2,3% (1) | 43 | 26,4 |
| 40 | SK SLovan | 14,6% (6) 56,1% (23) 14,6% (6) 14,6% (6) | 41 | 26,4 |
| 41 | Shamrock | 25,0% (7) 39,3% (11) 21,4% (6) 14,3% (4) | 28 | 26,5 |
| 42 | Olympiakos | 14,3% (8) 53,6% (30) 23,2% (13) 8,9% (5) | 56 | 26,6 |
| 43 | Valur | 21,9% (7) 31,2% (10) 37,5% (12) 6,2% (2) | 32 | 26,6 |
| 44 | Zalgiris | 18,5% (5) 48,1% (13) 22,2% (6) 11,1% (3) | 27 | 26,7 |
| 45 | Linfield | 20,6% (7) 44,1% (15) 17,6% (6) 14,7% (5) | 34 | 26,8 |
| 46 | Benfica | 18,4% (9) 49,0% (24) 24,5% (12) 8,2% (4) | 49 | 26,8 |
| 47 | Om. Nikosia | 28,2% (11) 25,6% (10) 25,6% (10) 20,5% (8) | 39 | 26,8 |
| 48 | Cluj | 20,0% (11) 43,6% (24) 25,5% (14) 10,9% (6) | 55 | 27,1 |
| 49 | Paola | 18,6% (8) 39,5% (17) 23,3% (10) 18,6% (8) | 43 | 27,4 |
| 50 | Connah's Quay | 3,6% (1) 39,3% (11) 28,6% (8) 14,3% (4) | 28 | 28,0 |
| 51 | Martuni | 5,3% (2) 36,8% (14) 44,7% (17) 13,2% (5) | 38 | 28,8 |
| 52 | Lincoln FC | 10,0% (4) 42,5% (17) 22,5% (9) 25,0% (10) | 40 | 29,0 |
| 53 | Folgore | 2,2% (1) 26,7% (12) 48,9% (22) 22,2% (10) | 45 | 30,4 |
| 54 | Inter Club de | 1,7% (1) 26,7% (16) 16,7% (10) 46,7% (28) | 60 | 32,4 |
Champions League-Qualifikation
