| 1 | Salzburg | 51,3% (20) 41,0% (16) 7,7% (3) | 39 | 22,7 |
| 2 | Kairat | 56,7% (17) 26,7% (8) 13,3% (4) 3,3% (1) | 30 | 23,1 |
| 3 | Rapid Wien | 50,0% (18) 30,6% (11) 16,7% (6) | 36 | 23,1 |
| 4 | NK Mura | 41,9% (13) 41,9% (13) 12,9% (4) 3,2% (1) | 31 | 23,4 |
| 5 | FC Flora | 47,1% (16) 35,3% (12) 11,8% (4) 5,9% (2) | 34 | 23,4 |
| 6 | Bodö/Glimt | 31,6% (12) 55,3% (21) 13,2% (5) | 38 | 23,6 |
| 7 | Midtjylland | 38,6% (17) 47,7% (21) 9,1% (4) 4,5% (2) | 44 | 23,7 |
| 8 | Spartak Moskau | 36,4% (16) 54,5% (24) 6,8% (3) 2,3% (1) | 44 | 23,8 |
| 9 | FK Buducnost | 44,8% (13) 31,0% (9) 13,8% (4) 6,9% (2) | 29 | 23,8 |
| 10 | Eindhoven | 47,1% (16) 41,2% (14) 5,9% (2) 5,9% (2) | 34 | 23,9 |
| 11 | Shakhtar | 23,1% (12) 63,5% (33) 11,5% (6) 1,9% (1) | 52 | 24,0 |
| 12 | FC Prishtina | 29,7% (11) 54,1% (20) 8,1% (3) 5,4% (2) | 37 | 24,1 |
| 13 | Genk | 37,5% (12) 46,9% (15) 12,5% (4) 3,1% (1) | 32 | 24,1 |
| 14 | Bröndby IF | 28,1% (9) 59,4% (19) 9,4% (3) 3,1% (1) | 32 | 24,3 |
| 15 | D. Zagreb | 29,4% (15) 51,0% (26) 13,7% (7) 3,9% (2) | 51 | 24,4 |
| 16 | Malmö FF | 41,7% (20) 33,3% (16) 12,5% (6) 12,5% (6) | 48 | 24,5 |
| 17 | Banja Luka | 37,9% (11) 37,9% (11) 17,2% (5) 6,9% (2) | 29 | 24,6 |
| 18 | Y.B. Bern | 29,0% (9) 58,1% (18) 6,5% (2) 6,5% (2) | 31 | 24,6 |
| 19 | M. Haifa | 26,9% (14) 53,8% (28) 15,4% (8) 3,8% (2) | 52 | 24,6 |
| 20 | C. Glasgow | 25,0% (11) 54,5% (24) 18,2% (8) 2,3% (1) | 44 | 24,7 |
| 21 | HB Torshavn | 24,2% (8) 57,6% (19) 12,1% (4) 6,1% (2) | 33 | 24,8 |
| 22 | Monaco | 28,9% (11) 47,4% (18) 13,2% (5) 10,5% (4) | 38 | 24,8 |
| 23 | S. Tiraspol | 21,1% (8) 68,4% (26) 5,3% (2) 5,3% (2) | 38 | 24,9 |
| 24 | Slavia Prag | 31,4% (16) 45,1% (23) 17,6% (9) 5,9% (3) | 51 | 24,9 |
| 25 | Sparta Prag | 23,9% (11) 52,2% (24) 17,4% (8) 4,3% (2) | 46 | 24,9 |
| 26 | L. Warschau | 34,1% (15) 40,9% (18) 18,2% (8) 6,8% (3) | 44 | 25,0 |
| 27 | D. Tiflis | 24,4% (10) 43,9% (18) 19,5% (8) 2,4% (1) | 41 | 25,0 |
| 28 | HJK Helsinki | 28,2% (11) 38,5% (15) 23,1% (9) 10,3% (4) | 39 | 25,4 |
| 29 | Saligorsk | 16,1% (5) 58,1% (18) 16,1% (5) 6,5% (2) | 31 | 25,5 |
| 30 | Fola Esch | 28,2% (11) 38,5% (15) 20,5% (8) 12,8% (5) | 39 | 25,6 |
| 31 | N. Baku | 25,9% (7) 44,4% (12) 22,2% (6) 7,4% (2) | 27 | 25,8 |
| 32 | Tetovo | 20,0% (7) 57,1% (20) 14,3% (5) 8,6% (3) | 35 | 25,9 |
| 33 | R. S. Belgrad | 27,9% (12) 30,2% (13) 32,6% (14) 4,7% (2) | 43 | 26,0 |
| 34 | Durres | 39,3% (11) 32,1% (9) 7,1% (2) 17,9% (5) | 28 | 26,1 |
| 35 | Ferencvárosi | 16,7% (6) 58,3% (21) 22,2% (8) 2,8% (1) | 36 | 26,2 |
| 36 | Gl. Rangers | 23,3% (10) 41,9% (18) 18,6% (8) 14,0% (6) | 43 | 26,2 |
| 37 | Galatasaray | 28,6% (16) 42,9% (24) 16,1% (9) 12,5% (7) | 56 | 26,2 |
| 38 | FK Rigas Futbo | 7,0% (3) 62,8% (27) 25,6% (11) 2,3% (1) | 43 | 26,4 |
| 39 | Shamrock | 25,0% (7) 39,3% (11) 21,4% (6) 14,3% (4) | 28 | 26,5 |
| 40 | Ludogorets | 12,5% (5) 52,5% (21) 25,0% (10) 5,0% (2) | 40 | 26,6 |
| 41 | Valur | 21,9% (7) 31,2% (10) 37,5% (12) 6,2% (2) | 32 | 26,6 |
| 42 | Olympiakos | 14,5% (8) 52,7% (29) 23,6% (13) 9,1% (5) | 55 | 26,6 |
| 43 | SK SLovan | 10,8% (4) 59,5% (22) 13,5% (5) 16,2% (6) | 37 | 26,7 |
| 44 | Zalgiris | 18,5% (5) 48,1% (13) 22,2% (6) 11,1% (3) | 27 | 26,7 |
| 45 | Benfica | 18,0% (9) 50,0% (25) 24,0% (12) 8,0% (4) | 50 | 26,8 |
| 46 | Linfield | 21,2% (7) 42,4% (14) 18,2% (6) 15,2% (5) | 33 | 26,8 |
| 47 | Om. Nikosia | 28,2% (11) 25,6% (10) 25,6% (10) 20,5% (8) | 39 | 26,8 |
| 48 | Cluj | 19,6% (11) 42,9% (24) 26,8% (15) 10,7% (6) | 56 | 27,2 |
| 49 | Paola | 19,0% (8) 38,1% (16) 23,8% (10) 19,0% (8) | 42 | 27,5 |
| 50 | Connah's Quay | 3,6% (1) 39,3% (11) 28,6% (8) 14,3% (4) | 28 | 28,0 |
| 51 | Martuni | 5,4% (2) 37,8% (14) 43,2% (16) 13,5% (5) | 37 | 28,8 |
| 52 | Lincoln FC | 10,5% (4) 39,5% (15) 23,7% (9) 26,3% (10) | 38 | 29,3 |
| 53 | Folgore | 2,2% (1) 26,7% (12) 48,9% (22) 22,2% (10) | 45 | 30,4 |
| 54 | Inter Club de | 3,4% (2) 25,4% (15) 16,9% (10) 45,8% (27) | 59 | 32,2 |
Champions League-Qualifikation
