| Land | Runde | ⊝ Age | Teilnahmen |
| AEK Athen | Griechenland | 4. Runde | 28,7 | 14 |
| AIK Solna | Schweden | 1. Runde | 25,3 | 8 |
| AO Xanthi | Griechenland | 1. Runde | 20,8 | 0 |
| Aberdeen | Schottland | 1. Runde | 23,2 | 12 |
| Ajdovscina | Slowenien | 1. Runde | - | 0 |
| Alavés | Spanien | 2. Runde | 27,5 | 1 |
| Ankaragücü | Türkei | 1. Runde | 21,5 | 1 |
| Apoel FC | Zypern | 2. Runde | 24,9 | 4 |
| Austria Wien | Österreich | 2. Runde | 25,1 | 6 |
| Auxerre | Frankreich | 4. Runde | 23,9 | 9 |
| Besiktas | Türkei | Viertelfinale | 34,5 | 5 |
| Blackburn | England | 2. Runde | 27,4 | 2 |
| Boavista | Portugal | Halbfinale | 28,0 | 11 |
| Bordeaux | Frankreich | 3. Runde | 25,6 | 17 |
| Bremen | Deutschland | 2. Runde | 26,1 | 11 |
| Brijeg | Bosnien-Herzegowina | 1. Runde | 26,5 | 0 |
| Bröndby IF | Dänemark | 1. Runde | 26,2 | 9 |
| C. Glasgow | Schottland | Finale | 24,1 | 14 |
| Celta Vigo | Spanien | 3. Runde | 27,0 | 5 |
| Ch. Verona | Italien | 1. Runde | 26,2 | 0 |
| Chelsea | England | 1. Runde | 27,1 | 5 |
| Club Brügge | Belgien | 3. Runde | 21,0 | 17 |
| D. Tiflis | Georgien | 1. Runde | 20,5 | 10 |
| D. Zagreb | Kroatien | 2. Runde | 23,0 | 19 |
| Denizlispor | Türkei | 4. Runde | 26,3 | 0 |
| Djurgardens | Schweden | 2. Runde | 21,3 | 5 |
| Dynamo Kiev | Ukraine | 3. Runde | 24,8 | 8 |
| FC Kärnten | Österreich | 1. Runde | 26,5 | 1 |
| FK Puchov | Slowakei | 1. Runde | - | 1 |
| FK Sarajevo | Bosnien-Herzegowina | 1. Runde | - | 2 |
| Famagusta | Zypern | 2. Runde | 29,3 | 5 |
| Fenerbahce | Türkei | 2. Runde | 24,4 | 14 |
| Ferencvárosi | Ungarn | 2. Runde | 25,7 | 15 |
| Fulham | England | 3. Runde | 28,3 | 0 |
| Genf | Schweiz | 1. Runde | 25,4 | 13 |
| Gl. Rangers | Schottland | 1. Runde | 22,7 | 13 |
| Gomel | Weißrussland | 1. Runde | - | 0 |
| Gr. Zürich | Schweiz | 2. Runde | 19,3 | 17 |
| Grazer AK | Österreich | 1. Runde | 26,9 | 8 |
| H. Tel Aviv | Israel | 2. Runde | 25,5 | 4 |
| Hajduk Split | Kroatien | 1. Runde | 23,0 | 12 |
| Heerenveen | Niederlande | 1. Runde | 21,7 | 0 |
| Hertha BSC | Deutschland | 4. Runde | 26,3 | 9 |
| Ipswich Town | England | 2. Runde | 26,8 | 9 |
| Iraklis | Griechenland | 1. Runde | 24,2 | 5 |
| Kocaelispor | Türkei | 1. Runde | 26,8 | 1 |
| Kopenhagen | Dänemark | 1. Runde | 24,3 | 4 |
| L. Warschau | Polen | 2. Runde | 27,4 | 9 |
| Lazio Rom | Italien | Halbfinale | 28,4 | 9 |
| Leeds United | England | 3. Runde | 24,7 | 12 |
| Leixoes | Portugal | 1. Runde | 19,0 | 1 |
| Leixoes SC M | Portugal | 1. Runde | - | 2 |
| Lens | Frankreich | 3. Runde | 25,7 | 6 |
| Levski Sofia | Bulgarien | 2. Runde | 23,2 | 11 |
| Liberec | Tschechien | 3. Runde | 22,0 | 2 |
| Liverpool | England | Viertelfinale | 24,1 | 11 |
| Livingston FC | Schottland | 1. Runde | 23,0 | 0 |
| Lorient | Frankreich | 1. Runde | 23,0 | 0 |
| Lovech | Bulgarien | 1. Runde | 24,7 | 3 |
| Lyon | Frankreich | 3. Runde | 26,0 | 12 |
| M. Donezk | Ukraine | 1. Runde | - | 0 |
| M. Haifa | Israel | 3. Runde | 27,1 | 2 |
| M. Tel Aviv | Israel | 1. Runde | 20,0 | 3 |
| Malaga | Spanien | Viertelfinale | 25,5 | 0 |
| Marijampole | Litauen | 1. Runde | - | 0 |
| Midtjylland | Dänemark | 2. Runde | 24,0 | 1 |
| Mouscron | Belgien | 1. Runde | 21,0 | 1 |
| National | Rumänien | 2. Runde | 25,0 | 1 |
| Odense | Dänemark | 1. Runde | 24,0 | 3 |
| P. Belgrad | Serbien | 2. Runde | 25,6 | 14 |
| P. Warschau | Polen | 1. Runde | 24,7 | 2 |
| PAOK Saloniki | Griechenland | 3. Runde | 25,0 | 14 |
| PSG | Frankreich | 3. Runde | 26,1 | 4 |
| Panathinaikos | Griechenland | Viertelfinale | 33,0 | 11 |
| Parma | Italien | 2. Runde | 24,7 | 7 |
| Porto | Portugal | Finale | 25,1 | 16 |
| R. S. Belgrad | Serbien | 2. Runde | 19,9 | 16 |
| RSC Anderlecht | Belgien | 4. Runde | 26,9 | 14 |
| Rapid | Rumänien | 1. Runde | - | 8 |
| Rapid Bucure | Rumänien | 1. Runde | 24,6 | 2 |
| Real Betis | Spanien | 3. Runde | 25,6 | 5 |
| SC FC Progresu | Rumänien | 2. Runde | 19,0 | 0 |
| SKM Puchov | Unbekannt | 1. Runde | - | 1 |
| Saporoschje | Ukraine | 1. Runde | - | 0 |
| Schalke | Deutschland | 3. Runde | 26,7 | 5 |
| Shakhtar | Ukraine | 1. Runde | 23,2 | 6 |
| Slavia Prag | Tschechien | 4. Runde | 22,4 | 14 |
| Smederevo | Serbien | 1. Runde | - | 0 |
| Sparta Prag | Tschechien | 2. Runde | 23,7 | 8 |
| Sporting | Portugal | 1. Runde | 22,0 | 23 |
| St. Petersburg | Russland | 1. Runde | 22,5 | 2 |
| Stabaek IF | Norwegen | 1. Runde | 22,6 | 1 |
| Stavanger | Norwegen | 2. Runde | 39,2 | 7 |
| Sturm Graz | Österreich | 3. Runde | 26,2 | 8 |
| Stuttgart | Deutschland | 4. Runde | 26,9 | 14 |
| Ujpest | Ungarn | 1. Runde | 31,5 | 12 |
| Utrecht | Niederlande | 1. Runde | 29,0 | 13 |
| Varazdin | Kroatien | 1. Runde | 26,0 | 1 |
| Ventspils | Lettland | 1. Runde | 25,0 | 0 |
| Vitesse | Niederlande | 3. Runde | 21,5 | 9 |
| W. Krakau | Polen | Achtelfinale | 26,7 | 6 |
| Wronki | Polen | 2. Runde | 25,2 | 2 |
| Z. Sarajevo | Bosnien-Herzegowina | 1. Runde | 19,0 | 3 |
| ZSKA Moskau | Russland | 1. Runde | 22,2 | 3 |
| ZSKA Sofia | Bulgarien | 1. Runde | 25,5 | 11 |
| Zalaegerszeg | Ungarn | 1. Runde | 27,5 | 0 |
| Zimbru | Moldawien | 1. Runde | 16,0 | 3 |
| Žižkov | Tschechien | 2. Runde | 22,0 | 1 |
Insgesamt nahmen 108 Mannschaften teil. The number of participations refers to tournament participations before the tournament. FC Fulham, FC Lorient, SC Heerenveen, AC Chievo Verona, FC Malaga, Denizlispor, NK Siroki Brijeg, AO Xanthi, FK Smederevo, FK Ventspils, FK Suduva Marijampole, Livingston FC, NK Primorje Ajdovscina, Metalurg Saporoschje, Metalurg Donezk, Zalaegerszegi TE, FC Gomel und SC FC Progresul Bucuresti participated in der Europa League for the first time.