| Land | Runde | ⊝ Age | Teilnahmen |
| AEK Athen | Griechenland | Gruppe H | 25,7 | 15 |
| Aachen | Deutschland | 3. Runde | 26,3 | 0 |
| Aigaleo | Griechenland | Gruppe E | 25,8 | 0 |
| Ajax Amsterdam | Niederlande | 3. Runde | 24,1 | 14 |
| Alkmaar | Niederlande | Halbfinale | 26,2 | 2 |
| Ath. Bilbao | Spanien | 3. Runde | 25,5 | 15 |
| Austria Wien | Österreich | Viertelfinale | 26,4 | 8 |
| Auxerre | Frankreich | Viertelfinale | 25,1 | 11 |
| Benfica | Portugal | 3. Runde | 25,4 | 12 |
| Besiktas | Türkei | Gruppe B | 25,2 | 7 |
| Club Brügge | Belgien | Gruppe C | 33,0 | 19 |
| D. Tiflis | Georgien | Gruppe D | 22,6 | 11 |
| D. Zagreb | Kroatien | Gruppe G | 25,4 | 21 |
| Dnjepr | Ukraine | 3. Runde | 25,2 | 8 |
| Dynamo Kiev | Ukraine | 3. Runde | 24,3 | 9 |
| Egaleo Athen | Griechenland | Gruppe E | 24,0 | 0 |
| FC Basel | Schweiz | 3. Runde | 25,8 | 14 |
| FK Liepaja | Lettland | 1. Runde | 23,0 | 1 |
| Fenerbahce | Türkei | 3. Runde | 25,5 | 15 |
| Ferencvárosi | Ungarn | Gruppe A | 27,3 | 17 |
| Feyenoord | Niederlande | 3. Runde | 23,2 | 17 |
| Genclerbirligi | Türkei | 1. Runde | 22,8 | 2 |
| Gl. Rangers | Schottland | Gruppe F | 23,0 | 14 |
| Gorica | Kroatien | 1. Runde | 22,0 | 3 |
| Grazer AK | Österreich | 3. Runde | 26,3 | 10 |
| Heerenveen | Niederlande | 3. Runde | 23,5 | 1 |
| KSK Beveren | Belgien | Gruppe G | 21,6 | 5 |
| Lazio Rom | Italien | Gruppe E | 27,7 | 10 |
| Lille | Frankreich | Achtelfinale | 24,2 | 1 |
| Lüttich | Belgien | Gruppe B | 26,3 | 11 |
| M. Haifa | Israel | 1. Runde | 25,8 | 4 |
| Middlesbrough | England | Achtelfinale | 24,1 | 0 |
| Midlothian | Schottland | Gruppe A | 23,3 | 11 |
| Newcastle | England | Viertelfinale | 24,8 | 8 |
| Olympiakos | Griechenland | Achtelfinale | 27,8 | 13 |
| P. Belgrad | Serbien | Achtelfinale | 23,5 | 15 |
| Panathinaikos | Griechenland | 3. Runde | 26,6 | 13 |
| Panionios | Griechenland | Gruppe D | 24,4 | 4 |
| Parma | Italien | Halbfinale | 24,4 | 9 |
| Petach Tikwa | Israel | 1. Runde | 22,0 | 1 |
| Saragossa | Spanien | Achtelfinale | 25,7 | 11 |
| Schalke | Deutschland | 3. Runde | 25,6 | 7 |
| Sevilla | Spanien | Achtelfinale | 25,5 | 6 |
| Shakhtar | Ukraine | Achtelfinale | 25,4 | 8 |
| Sochaux | Frankreich | 3. Runde | 25,1 | 6 |
| Sporting | Portugal | Finale | 21,7 | 25 |
| St. Petersburg | Russland | Gruppe H | 24,8 | 3 |
| Steaua | Rumänien | Achtelfinale | 25,8 | 8 |
| Stuttgart | Deutschland | 3. Runde | 25,3 | 15 |
| Utrecht | Niederlande | Gruppe C | 27,0 | 15 |
| Valencia | Spanien | 3. Runde | 26,1 | 21 |
| Villarreal | Spanien | Viertelfinale | 26,0 | 1 |
| Wronki | Polen | Gruppe F | 24,9 | 3 |
| ZSKA Moskau | Russland | Finale | 23,3 | 4 |
Insgesamt nahmen 54 Mannschaften teil. The number of participations refers to tournament participations before the tournament. Alemannia Aachen, FC Middlesbrough, AO Aigaleo und AO Egaleo Athen participated in der Europa League for the first time.