| Land | Runde | ⊝ Age | Teilnahmen |
| A. Bratislav | Slowakei | 1. Runde | 32,8 | 2 |
| AC Florenz | Italien | Achtelfinale | 24,0 | 16 |
| AC Mailand | Italien | Achtelfinale | 26,5 | 11 |
| Aalborg | Dänemark | Sechzehntelfinale | 25,2 | 2 |
| Ajax Amsterdam | Niederlande | Sechzehntelfinale | 23,4 | 17 |
| Apoel FC | Zypern | 1. Runde | 28,7 | 7 |
| Aston Villa | England | Achtelfinale | 22,8 | 10 |
| Austria Wien | Österreich | 1. Runde | 25,9 | 12 |
| Bellinzona | Schweiz | 1. Runde | 26,4 | 0 |
| Belupo | Kroatien | 1. Runde | 22,0 | 0 |
| Benfica | Portugal | 1. Runde | 24,7 | 15 |
| Bergen | Norwegen | 1. Runde | 25,9 | 6 |
| Besiktas | Türkei | 1. Runde | 23,8 | 10 |
| Borac Cacak | Serbien | 1. Runde | 22,3 | 0 |
| Bordeaux | Frankreich | Achtelfinale | 22,5 | 21 |
| Braga | Portugal | Sechzehntelfinale | 23,9 | 6 |
| Bremen | Deutschland | Finale | 24,4 | 14 |
| Bröndby IF | Dänemark | 1. Runde | 24,9 | 13 |
| CM Varna | Bulgarien | 1. Runde | 30,5 | 0 |
| Club Brügge | Belgien | 1. Runde | 27,4 | 23 |
| D. Zagreb | Kroatien | 1. Runde | 23,2 | 24 |
| Deportivo | Spanien | Achtelfinale | 26,8 | 4 |
| Dinamo | Rumänien | 1. Runde | 26,3 | 15 |
| Dortmund | Deutschland | 1. Runde | 26,5 | 10 |
| Dynamo Kiev | Ukraine | Halbfinale | 23,5 | 10 |
| Everton | England | 1. Runde | 24,2 | 8 |
| FC Honka | Finnland | 1. Runde | 27,2 | 0 |
| FC Twente | Niederlande | Achtelfinale | 23,5 | 14 |
| FC Zürich | Schweiz | 1. Runde | 21,9 | 11 |
| FK Moskau | Russland | 1. Runde | 24,2 | 0 |
| Feyenoord | Niederlande | 1. Runde | 24,2 | 20 |
| Galatasaray | Türkei | Sechzehntelfinale | 23,8 | 10 |
| Guimaraes | Portugal | 1. Runde | 29,9 | 12 |
| H. Tel Aviv | Israel | 1. Runde | 24,6 | 8 |
| Hamburg | Deutschland | Halbfinale | 24,9 | 16 |
| Heerenveen | Niederlande | 1. Runde | 24,0 | 5 |
| Hertha BSC | Deutschland | 1. Runde | 24,9 | 13 |
| Kalmar | Schweden | 1. Runde | 28,7 | 2 |
| Kaunas | Litauen | 1. Runde | 24,2 | 0 |
| Kayserispor | Türkei | 1. Runde | 25,7 | 1 |
| Kopenhagen | Dänemark | Achtelfinale | 26,6 | 8 |
| Levski Sofia | Bulgarien | 1. Runde | 25,9 | 14 |
| Lovech | Bulgarien | 1. Runde | 21,2 | 7 |
| Lüttich | Belgien | Achtelfinale | 23,1 | 14 |
| Madeira | Portugal | 1. Runde | 26,6 | 4 |
| Man. City | England | Viertelfinale | 22,0 | 5 |
| Metalist | Ukraine | Sechzehntelfinale | 26,2 | 1 |
| Motherwell | Schottland | 1. Runde | 24,3 | 1 |
| Nancy | Frankreich | 1. Runde | 26,2 | 1 |
| Nijmegen | Niederlande | Achtelfinale | 24,6 | 1 |
| Nordsjælland | Dänemark | 1. Runde | 33,1 | 1 |
| Ol. Marseille | Frankreich | Viertelfinale | 24,8 | 11 |
| Olympiakos | Griechenland | Achtelfinale | 26,5 | 14 |
| Om. Nikosia | Zypern | 1. Runde | 31,6 | 4 |
| Ostrava | Tschechien | 1. Runde | 24,1 | 9 |
| P. Belgrad | Serbien | Gruppe C | 23,0 | 18 |
| PSG | Frankreich | Viertelfinale | 24,6 | 6 |
| Petrzalka | Slowakei | 1. Runde | 23,0 | 4 |
| Portsmouth | England | 1. Runde | 23,6 | 0 |
| Poznan | Polen | Achtelfinale | 24,3 | 3 |
| Rapid | Rumänien | 1. Runde | 28,1 | 11 |
| Rapid Bucure | Rumänien | 1. Runde | 27,5 | 6 |
| Rennes | Frankreich | 1. Runde | 24,1 | 2 |
| Rodina Moskva | Russland | 1. Runde | - | 0 |
| Rosenborg BK | Norwegen | 1. Runde | 24,2 | 10 |
| S. Genua | Italien | Achtelfinale | 23,8 | 4 |
| SSC Neapel | Italien | 1. Runde | 27,1 | 16 |
| Salzburg | Österreich | 1. Runde | 26,7 | 8 |
| Santander | Spanien | 1. Runde | 23,2 | 0 |
| Schalke | Deutschland | 1. Runde | 25,6 | 10 |
| Setubal | Portugal | 1. Runde | 28,1 | 12 |
| Sevilla | Spanien | 1. Runde | 27,0 | 9 |
| Shakhtar | Ukraine | Finale | 24,7 | 11 |
| Slavia Prag | Tschechien | 1. Runde | 24,6 | 19 |
| Sparta Prag | Tschechien | 1. Runde | 25,3 | 11 |
| Spartak Moskau | Russland | 1. Runde | 22,9 | 18 |
| St. Etienne | Frankreich | Sechzehntelfinale | 24,6 | 4 |
| St. Patrick´s | Irland | 1. Runde | 33,0 | 2 |
| St. Petersburg | Russland | Sechzehntelfinale | 25,2 | 6 |
| Stuttgart | Deutschland | Achtelfinale | 24,9 | 17 |
| Timisoara | Rumänien | 1. Runde | 25,1 | 3 |
| Tottenham | England | Achtelfinale | 22,2 | 8 |
| Udinese | Italien | Viertelfinale | 23,0 | 6 |
| Urziceni | Rumänien | 1. Runde | 28,3 | 0 |
| Valencia | Spanien | Achtelfinale | 25,3 | 22 |
| Vaslui | Rumänien | 1. Runde | 24,8 | 0 |
| W. Krakau | Polen | 1. Runde | 24,6 | 10 |
| Wolfsburg | Deutschland | Achtelfinale | 25,6 | 1 |
| Y.B. Bern | Schweiz | 1. Runde | 25,2 | 2 |
| ZSKA Moskau | Russland | Sechzehntelfinale | 22,1 | 7 |
| Zilina | Slowakei | 1. Runde | 26,1 | 1 |
Insgesamt nahmen 91 Mannschaften teil. The number of participations refers to tournament participations before the tournament. FC Portsmouth, Racing Santander, AC Bellinzona, Cherno More Varna, FC Honka Espoo, FK Borac Cacak, NK Slaven Belupo, FBK Kaunas, FC Vaslui, Unirea Urziceni, FK Moskau und Rodina Moskva participated in der Europa League for the first time.